後勁溪，短短21公里，沿岸是高雄市的工業重鎮，包括台塑仁武廠、仁武工業區、大社工業區和工廠群聚的竹子門地區，工業廢水排入後勁溪，下游的農田從後勁溪引水灌溉，面對灌溉水質不佳的狀況，農民只能自求多福，因為後勁溪屬於區域排水，主管權限在高雄市政府，農田水利會沒有權力要求上游業者，將廢水處理到符合灌溉水質標準，才能排放，雖然高雄農田水利會在民國79年，規劃了灌排分離工程，卻因為經費龐大、水量豐枯等因素，始終難以達成。

彰化縣是台灣的糧倉，卻也是農地汙染最嚴重的縣市。每當二期稻作開始插秧，東西三圳豐沛的水源，灌溉著彰化市和和美地區的農地，但北彰化電鍍工廠林立，過去電鍍廢水直接排到水圳，導致汙染事件一再發生，彰化農田水利會於是禁止業者搭排，要求以附掛管方式，把廢水直接拉到區域排水再排放，這也是灌排分離的做法，但彰化地檢署從去年11月開始，查緝電鍍業者違法偷排廢水，第一波掃蕩中，就有四家業者長期用暗管，把電鍍原廢水直接排到水圳裡。

新竹市香山地區的汙染農地面積，曾經達到33公頃，整治完畢後還是種出鎘米，經過農業試驗所用氯化鐵洗去重金屬，並調整土壤PH值後，終於讓農地活化、恢復生產。但汙染隱憂並沒有消除，因為新竹農田水利會的汀甫圳八輪支線，兼具灌溉與排水功能，旁邊緊鄰香山工業，工業區內的廢水，就從排水溝流進水圳，曾經造成下游農地汙染。

桃園是工業大縣，也名列汙染農地排行榜的第二名。黃墘溪堤岸邊有一條水泥涵管，強勁水流奔騰而出，這是中壢工業區的工業廢水，只要符合環保署訂定的放流水標準，就是合法排放，但對黃墘溪這條小溪來說，卻是沉重的負擔。離中壢工業區汙水排放口約兩三公里，就有一個水閘門，黃墘溪水被引入灌溉農田，水還呈現淡紫色，拿來灌溉等於讓農地慢性中毒，長久累積難保不會汙染超標。

環保署共計花了6億，整治這些汙染農地，卻還有302公頃等待整治，如果繼續放任汙染，土汙基金早晚會破產。於是民國102年，環保署向桃園、彰化兩個農田水利會以潛在汙染責任人，追討1/2的整治費用，分別是300多萬與800多萬，終於迫使相關單位共同面對問題，催生了「農業灌溉水質保護方案」。

然而農業灌溉水質標準不是法規，對廠商沒有約束力，除非搭排到農田水利會所主管的水圳或渠道，才能要求業者做到符合灌溉水質標準，灌排分離的呼聲，民間團體喊了很久，始終看不到任何蹤影。一場立法院公聽會上，地球公民基金會研究員呂翊齊更提出，灌排分離一定要立法，否則將可能因為經濟部等單位施壓，難以執行。

農地是跨世代台灣人民生存的依靠，糧食安全和自給率應該提升到國安層級，而擔任農業水質守門員的農田水利會，卻是個法人機構，不具有公權力，相對也不必負責任，農地汙染攸關糧食生產的安全與否，進一步連結到全民的健康，該如何讓農地受到妥善保護，就看政府重不重視。